Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms