Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cspg5Q71M36 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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