Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Topbp1Q6ZQF0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms