Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms