Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CtifQ6PEE2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms