Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mfsd13aQ6PDE8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Mfsd13aQ6PDE8 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms