Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim37Q6PCX9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
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