Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RgmaQ6PCX7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RgmaQ6PCX7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RgmaQ6PCX7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RgmaQ6PCX7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms