Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrimpolQ6P1E7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrimpolQ6P1E7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms