Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
NipblQ6KCD5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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