Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sohlh1Q6IUP1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Sohlh1Q6IUP1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms