Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CltbQ6IRU5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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