Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt39Q6IFX4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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