Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt40Q6IFX3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt40Q6IFX3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms