Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Spty2d1Q68FG3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Spty2d1Q68FG3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms