Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Sdc3Q64519 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sdc3Q64519 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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