Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Zfp248Q640N4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp248Q640N4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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