Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc18Q640L5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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