Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ndufa4Q62425 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ndufa4Q62425 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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