Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prkd1Q62101 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prkd1Q62101 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms