Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim25Q61510 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms