Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ecm1Q61508 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ecm1Q61508 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms