Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lamb3Q61087 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms