Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rbbp7Q60973 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms