Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbbp4Q60972 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbbp4Q60972 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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