Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rasa3Q60790 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms