Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SkiQ60698 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms