Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm23757-201ENSMUST00000158353 100 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Foxd4Q60688 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Foxd4Q60688 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Foxd4Q60688 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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