Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tsr1Q5SWD9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tsr1Q5SWD9 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tsr1Q5SWD9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tsr1Q5SWD9 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tsr1Q5SWD9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tsr1Q5SWD9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tsr1Q5SWD9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tsr1Q5SWD9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tsr1Q5SWD9 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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