Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Psme4Q5SSW2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms