Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms