Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Utp18Q5SSI6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Utp18Q5SSI6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms