Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc1Q5NCF2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms