Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim41Q5NCC3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim41Q5NCC3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms