Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Znf354cQ571J5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Znf354cQ571J5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms