Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM5

Miga1, Mitoguardin 1, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Miga1Q4QQM5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Miga1Q4QQM5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Miga1Q4QQM5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Miga1Q4QQM5 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Miga1Q4QQM5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Miga1Q4QQM5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms