Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx25Q3ZT31 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Snx25Q3ZT31 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Snx25Q3ZT31 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx25Q3ZT31 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx25Q3ZT31 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Snx25Q3ZT31 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx25Q3ZT31 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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