Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrrc43Q3V0L5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Lrrc43Q3V0L5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrrc43Q3V0L5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms