Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Pfdn4Q3UWL8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pfdn4Q3UWL8 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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