Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gm29609Q3UU56 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm29609Q3UU56 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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