Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Fchsd2Q3USJ8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Fchsd2Q3USJ8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms