Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm28047Q3US59 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm28047Q3US59 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms