Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf48Q3US17 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Znf48Q3US17 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Znf48Q3US17 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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