Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms