Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sec31aQ3UPL0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Sec31aQ3UPL0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sec31aQ3UPL0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms