Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tmem253Q3UNB8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tmem253Q3UNB8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tmem253Q3UNB8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tmem253Q3UNB8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tmem253Q3UNB8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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