Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc33Q3ULW6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc33Q3ULW6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms