Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q3UJP5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q3UJP5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms