Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Usp19Q3UJD6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Usp19Q3UJD6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms