Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx27Q3UHD6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx27Q3UHD6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx27Q3UHD6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Snx27Q3UHD6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snx27Q3UHD6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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